免疫组分析平台
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Immunomics analysis portal

AWeb一站式免疫组数据分析平台

平台打通 FASTQ 原始数据分析与 CDR3 表分析两条流程，自动识别单链、多链与七链场景，标准化输出交付级免疫组报告。

开始分析 查看使用帮助
  1. 01注册并登录账户
  2. 02上传 FASTQ 或 CDR3 文件
  3. 03启动分析并等待任务完成
  4. 04预览结果并在下载中心导出

Result carousel

分析结果示意图展示

图片取自平台测试数据的真实分析结果，涵盖 CDR3、时间轨迹与组间对比分析。

Analysis atlas

分析图谱一览

每张图旁均配气泡解读，帮助快速理解免疫组库特征。

◷

多样性曲线

用 Shannon、Simpson、D50 等指标量化克隆多样性，反映免疫库的丰富度与均一程度。

NEW ◣

秩-频率分布曲线

将克隆按丰度排序后绘制递减曲线，一眼看出少数高频克隆是否主导整个免疫库，量化克隆扩增程度。

▦

Treemap 克隆空间

以嵌套色块按 V→J→CDR3 逐层展开，面积对应克隆丰度，直观呈现优势克隆所占的空间比例。

▤

克隆稳态分布

按出现频率分档统计克隆占比，判断免疫库是均衡分布还是被少数扩增克隆占据。

▥

V · J 基因使用

统计各 V、J 基因片段的使用频率及其配对组合，刻画 V(D)J 重组的偏好特征。

∿

CDR3 长度谱

统计 CDR3 氨基酸长度的分布形态，谱型偏移往往提示克隆选择与多样性的改变。

≡

Top 克隆表

列出丰度最高的克隆及其 V/J 基因、CDR3 序列与占比，便于快速锁定优势克隆。

❡

测序原理说明

内置测序原理、文库构建与生信分析流程的图文说明，帮助读者理解数据来源与处理过程。

Analysis

数据分析

先选择分析入口，再进入对应的上传分析页面。

FASTQ

FASTQ 上传分析

FASTQ 原始数据分析

上传前请确认

  1. FASTQ 必须为双端文件并成对上传，文件名以 _R1.fq.gz / _R2.fq.gz 结尾。
  2. 同时上传一份 iREM 信息表（CSV），其中 Chains 列声明每个样本的链类型。
  3. 链类型由 iREM 表的 Chains 列自动识别，单链填 1 条链，七链填 TRA TRB TRD TRG IGH IGK IGL。
  4. 按实际下机读长选择测序类型 PE300 或 PE250。
  5. 流程依次完成拆分、比对、克隆型鉴定与报告生成，可关闭页面稍后回来查看。

示例表演示了表头与样本数据格式，请替换 QC ID、Project Name、Sample Name 与 Chains 等关键信息，并删除末尾的示例提示行后再上传。

CDR3

CDR3 上传分析

CDR3 表分析

上传的文件名必须包含链名称，例如 TRA、TRB、IGH。

上传格式要求 · 查看示例数据表头

上传的 CSV 必须符合示例格式（dataset/示例数据_TRA_pep.csv），须包含以下列：

junction_aa, junction, v_call, d_call, j_call, duplicate_count 下载示例数据
没有数据？点击获取测试数据
单链测试数据 七链测试数据

TRAJECTORY

时间轨迹分析

免疫组库时间轨迹分析

上传前请确认

  1. 上传同一受试者在多个时间点的 CDR3 结果表，系统将按时间先后比对分析。
  2. 文件名必须包含链信息（如 _TRA_、_TRB_、_IGH_ 等）。
  3. 文件名必须包含时间点信息（如 _T1_、_T2_、_T3_ 等），且至少包含两个时间点。
  4. 同一受试者的所有文件共用相同的样本前缀，系统据此归为一份报告（一人一份报告）。
  5. 示例文件名：zhangsan_T1_TRA_pep.csv、zhangsan_T2_TRA_pep.csv。

上传的文件名必须同时包含链名称（如 TRA、IGH）与时间点（如 T1、T2），并且至少包含两个时间点。

上传格式要求 · 查看示例数据表头

上传的 CSV 必须符合示例格式（dataset/示例数据_TRA_pep.csv），须包含以下列：

junction_aa, junction, v_call, d_call, j_call, duplicate_count
下载示例数据 下载测试数据

COMPARE

组间对比分析

免疫组库组间对比分析

上传前请确认

  1. 分别上传两组（如患者 vs 对照）的 CDR3 结果表，系统将进行组间对比分析。
  2. 文件名必须包含链信息（如 _TRA_、_TRB_、_IGH_ 等），两组需含相同链。
  3. 每组可包含多个样本；样本量越大，差异基因检验越可靠（每组建议 ≥2 个样本）。
  4. 可为两组自定义名称，将用于报告中的图例与标题。

两组文件名均须包含链名称（如 TRA、IGH）。每组可含多个样本文件。

上传格式要求 · 查看示例数据表头

上传的 CSV 必须符合示例格式（dataset/示例数据_TRA_pep.csv），须包含以下列：

junction_aa, junction, v_call, d_call, j_call, duplicate_count
下载示例数据 下载测试数据

Results

结果展示

仅展示当前登录账户自己的分析结果。

Downloads

下载中心

集中下载当前登录账户的分析结果文件。

Login

账号登录

密码需为 8 到 16 位字母数字组合，区分大小写。

密码需为 8 到 16 位字母数字组合，区分大小写。

Help

使用帮助

1. 注册与登录

使用邮箱接收验证码，完成注册后用账号密码登录平台。

2. 选择分析入口

FASTQ 工作流用于原始数据分析，CDR3 工作流用于结果表分析。

3. 上传后点击分析

上传只负责保存文件，必须点击“开始分析”才会启动 pipeline。

4. 查看结果与下载

结果展示页用于预览图表和指标，下载中心提供 HTML 报告和结果文件。

报告类型 · 单链报告（1 条链）

面向单一受体链，系统呈现克隆多样性、丰度结构与基因使用特征。

报告类型 · 多链报告（2 – 6 条链）

在链别概览中横向比较各链，并为每条链生成独立子页，便于解读 TCR 与 BCR 的组合特征。

报告类型 · 全链七链报告（7 条链）

覆盖 TRA、TRB、TRD、TRG、IGH、IGK、IGL 七条链，以独立子页构建完整的 T/B 细胞免疫画像。系统按有效链数量自动选择报告结构。